RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 AP5Z1O43299 807 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX18O95935 607 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 NTSR1P30989 418 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD12P35452 270 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 AFMP43652 599 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 AP3M2P53677 418 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 DLG4P78352 724 aa27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ERLEC1Q96DZ1 483 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOX2Q99424 681 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC32A1Q9H598 525 aa27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 ASPMQ8IZT6 3477 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K7CLP57077 242 aa27.11■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PIP4P1Q86T03 277 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A14Q9UN76 642 aa27.11■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF33AQ06730 810 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC36A4Q6YBV0 504 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT18Q6ZVK8 323 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf29Q8N999 325 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO44Q9H4M3 255 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 TYRP14679 529 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFV2P19404 249 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 MARK1Q9P0L2 795 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 CYP26A1O43174 497 aa27.07■■□□□ 1.92
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CAPNS1-211ENST00000590874 MDM4O15151 490 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC20AQ6ZU45 233 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SV2AQ7L0J3 742 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HDDC3Q8N4P3 179 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA12BQ96MM6 686 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TWNKQ96RR1 684 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD10Q9H3F6 313 aa27.06■■□□□ 1.92
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