RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TLR9Q9NR96 1032 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 C1RP00736 705 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PYGMP11217 842 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 NCAM1P13591 858 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 HDAC4P56524 1084 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ODF2Q5BJF6 829 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A14Q96JA4 679 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF25Q9BQ70 676 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 EFCAB8A8MWE9 144 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 F9P00740 461 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CNPP09543 421 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF4P15884 667 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ATF6P18850 670 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH1A3P47895 512 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHAF4Q5VUM1 108 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 BTBD8Q5XKL5 378 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 POF1BQ8WVV4 589 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4F11Q9HBI6 524 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-206ENST00000588815 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CA3P07451 260 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-21P61565 698 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SYPL2Q5VXT5 272 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC38A8A6NNN8 435 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 GRXCR1A8MXD5 290 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MDM4O15151 490 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 LPXNO60711 386 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC24AO95486 1093 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CSH1P0DML2 217 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CSH2P0DML3 217 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 IL1R2P27930 398 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 RDXP35241 583 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PLD1Q13393 1074 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA4Q8NEY3 305 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MAIP1Q8WWC4 291 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 OVCA2Q8WZ82 227 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO32Q969P5 355 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SLITRK1Q96PX8 696 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 DENND4CQ5VZ89 1909 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 M0QYT0 321 aa32.36■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 FGGP02679 453 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOGP15173 224 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CA8P35219 290 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPN7P35236 360 aa32.36■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 AIF1P55008 147 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 VEPH1Q14D04 833 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 VSIG1Q86XK7 387 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PDZD8Q8NEN9 1154 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL5Q96PQ7 755 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ZWILCHQ9H900 591 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PCSK1NQ9UHG2 260 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 YIPF1Q9Y548 306 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC188H7C350 402 aa32.35■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 TADA3O75528 432 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT1P04264 644 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVFC1P60507 584 aa32.35■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 SCD5Q86SK9 330 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 EFR3BQ9Y2G0 817 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 FSCN2O14926 492 aa32.35■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 GBP1P32455 592 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 DEUP1Q05D60 604 aa32.35■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa32.35■■■□□ 2.77
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC50Q8IVM0 306 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A14Q8TBB6 771 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PEBP4Q96S96 227 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 OBSL1O75147 1896 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf71A6NGG8 1288 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP8BP34820 402 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PDK2Q15119 407 aa32.34■■■□□ 2.77
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