RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574007.5

P4HB-218, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene P4HB, Length 1,053 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HB-218ENST00000574007 USP3Q9Y6I4 520 aa14.7□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 EML5Q05BV3 1969 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 K7EQS6 105 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 TULP2O00295 520 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 P4HA2O15460 535 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 VDRP11473 427 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CNR2P34972 360 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PSEN1P49768 467 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 BCAT1P54687 386 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 GAD2Q05329 585 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 KDSRQ06136 332 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PDE4CQ08493 712 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 MESP2Q0VG99 397 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 KCNH2Q12809 1159 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 TMEM270Q6UE05 265 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 HTR3DQ70Z44 454 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 KAT5Q92993 513 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ACDQ96AP0 544 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 HHIPQ96QV1 700 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PNKPQ96T60 521 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ANTXRLA6NF34 631 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 GREM1O60565 184 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 KAT7O95251 611 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 APODP05090 189 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CCDC192P0DO97 292 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 RALAP11233 206 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PLA2G4AP47712 749 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 TKTL1P51854 596 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 DMC1Q14565 340 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 C2orf27AQ580R0 203 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 RAB41Q5JT25 222 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CEP68Q76N32 757 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 SYT13Q7L8C5 426 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 TMEM25Q86YD3 366 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 MIB1Q86YT6 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 NAT16Q8N8M0 369 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 LMO3Q8TAP4 145 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 UBA3Q8TBC4 463 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 USP33Q8TEY7 942 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.68□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 O00370 1275 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PAEPP09466 180 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ANO4Q32M45 955 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 RRAGAQ7L523 313 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ZNF276Q8N554 614 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 TFAP2BQ92481 460 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.67□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 AXIN1O15169 862 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 TULP3O75386 442 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 STC2O76061 302 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 APBB3O95704 486 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ZBED1O96006 694 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 HMBSP08397 361 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 SETSIPP0DME0 302 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 GRIA2P42262 883 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 EFEMP1Q12805 493 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
P4HB-218ENST00000574007 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms