RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569304.1

RAB11A-208, Transcript of RAB11A, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB11A, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11A-208	ENST00000569304	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304		J3KRW8	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PPP6R2	O75170	966 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CER1	O95813	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PEX11B	O96011	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	POLB	P06746	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RHO	P08100	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PBX1	P40424	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MTHFS	P49914	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TLE2	Q04725	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PLP2	Q04941	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CDSN	Q15517	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304		A8MVJ9	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304		E7EVH7	732 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CNTF	P26441	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	LIPA	P38571	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TBCC	Q15814	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CPT1B	Q92523	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	LENG9	Q96B70	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MECR	Q9BV79	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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