RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 TMC2Q8TDI7 906 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TAF4BQ92750 862 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PAGE5Q96GU1 130 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 NACA2Q9H009 215 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 EXOC1Q9NV70 894 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PDXKO00764 312 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TBX18O95935 607 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 NR3C1P04150 777 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 GABRG2P18507 467 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 LMAN2Q12907 356 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 ATL3Q6DD88 541 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PGBD3Q8N328 593 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CD248Q9HCU0 757 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CYLDQ9NQC7 956 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 OSER1Q9NX31 292 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 A0A1W2PQF6 199 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 HHLA1C9JL84 531 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CACNG3O60359 315 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PROS1P07225 676 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 HOXB2P14652 356 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PKP1Q13835 747 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 LYSMD4Q5XG99 296 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 SLC23A3Q6PIS1 610 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TWNKQ96RR1 684 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 MARK1Q9P0L2 795 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PILRBQ9UKJ0 227 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 SCML2Q9UQR0 700 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 IKBKBO14920 756 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 FAM200BP0CF97 657 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 ENGP17813 658 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 NTSR1P30989 418 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 INCA1Q0VD86 236 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 FOXC1Q12948 553 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 UAP1L1Q3KQV9 507 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 LAMA1P25391 3075 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CYP26A1O43174 497 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 HLA-DRAP01903 254 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 C1QTNF9P0C862 333 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 ITPKAP23677 461 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 ADORA2BP29275 332 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 HOXD12P35452 270 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 DPP6P42658 865 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 WASP42768 502 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 DEFB124Q8NES8 71 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 ACOX2Q99424 681 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 NMUR1Q9HB89 426 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CFAP45Q9UL16 551 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 AP5Z1O43299 807 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TYRP14679 529 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 SPINK2P20155 84 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PIK3CAP42336 1068 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 MAPK8P45983 427 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 CEP135Q66GS9 1140 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 BBS2Q9BXC9 721 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-210ENST00000568485 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 PRRT4C9JH25 899 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 MAPK13O15264 365 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 KIAA1211LQ6NV74 962 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 Q6ZNB5 142 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 TPGS1Q6ZTW0 290 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 P2RY11Q96G91 374 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 GABRG3Q99928 467 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
E2F4-210ENST00000568485 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.3 ms