RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TOR1B	O14657	336 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NCK2	O43639	380 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GFPT2	O94808	682 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	BAG2	O95816	211 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH2	P05091	517 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM200B	P0CF97	657 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MYB	P10242	640 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP3CB	P16298	524 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TSHR	P16473	764 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	XBP1	P17861	261 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMA3	P25788	255 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNS	P34059	522 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA7	P48741	367 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	VAMP2	P63027	116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	STARD3	Q14849	445 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRR	Q15256	657 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNRD1	Q16881	649 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG9B	Q674R7	924 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	USP43	Q70EL4	1123 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPH3	Q86UC2	560 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ESX1	Q8N693	406 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL20	Q96IG2	436 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CGRRF1	Q99675	332 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	APOL5	Q9BWW9	433 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEH1	Q9H213	219 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	USP19	O94966	1318 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPC4	97 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC154	A6NI56	674 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MYMK	A6NI61	221 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00473	A8K010	186 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957		E7ENX8	843 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT5	O00445	386 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP6C	O00743	305 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KPNA5	O15131	536 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBED4	O75132	1171 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	IL18RAP	O95256	599 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GLUL	P15104	373 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	UBA7	P41226	1012 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH9A1	P49189	494 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP14	P50281	582 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00205	P59089	165 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF7	P61962	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DSC2	Q02487	901 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TAP2	Q03519	686 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FPGS	Q05932	587 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF844	Q08AG5	666 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HYAL1	Q12794	435 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DAG1	Q14118	895 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB39A	Q14964	217 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD6	Q15008	389 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MPEG1	Q2M385	716 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM153C	Q494X1	144 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	POC1B	Q8TC44	478 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB12	Q8WXK4	309 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RFFL	Q8WZ73	363 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KAT5	Q92993	513 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PGBD1	Q96JS3	809 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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