RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
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RABGGTA-211ENST00000559850 NFATC1O95644 943 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 ZBED1O96006 694 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 SP9P0CG40 484 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 SETSIPP0DME0 302 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 PLA2G4AP47712 749 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC6A11P48066 632 aa15.59■□□□□ 0.09
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RABGGTA-211ENST00000559850 EFEMP1Q12805 493 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 DHCR24Q15392 516 aa15.59■□□□□ 0.09
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RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa15.59■□□□□ 0.09
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RABGGTA-211ENST00000559850 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 EDEM1Q92611 657 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-211ENST00000559850 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.59■□□□□ 0.09
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RABGGTA-211ENST00000559850 FAM170AA1A519 330 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 E7ENQ6 273 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 THAP12O43422 761 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 GREM1O60565 184 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 RALAP11233 206 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 KLK7P49862 253 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SATB1Q01826 763 aa15.58■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 CCINQ13939 588 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC32Q14392 662 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 KRT31Q15323 416 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 C12orf40Q86WS4 652 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 GNA15P30679 374 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 OPRD1P41143 372 aa15.57■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.57■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SHC3Q92529 594 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 CD101Q93033 1021 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.57■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 RNF40O75150 1001 aa15.56■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 ADH5P11766 374 aa15.56■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM25Q86YD3 366 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 NAT16Q8N8M0 369 aa15.56■□□□□ 0.08
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RABGGTA-211ENST00000559850 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 ST7Q9NRC1 585 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 TBC1D14Q9P2M4 693 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC12A8A0AV02 714 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 KLKB1P03952 638 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 NBL1P41271 181 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 GPD2P43304 727 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SEC13P55735 322 aa15.55■□□□□ 0.08
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