RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 COG7P83436 770 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 PARM1Q6UWI2 310 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SCUBE3Q8IX30 993 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CPA5Q8WXQ8 436 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 IRF7Q92985 503 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 TRIM11Q96F44 468 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CPXM1Q96SM3 734 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 BRD9Q9H8M2 597 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 POPDC2Q9HBU9 364 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ASNSD1Q9NWL6 643 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CPQQ9Y646 472 aa18.75■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 COCHO43405 550 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MFAP3LO75121 409 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ASGR2P07307 311 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CFHP08603 1231 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 NCAM1P13591 858 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 IFNAR2P48551 515 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CENPCQ03188 943 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 FGF14Q92915 247 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 EXOC4Q96A65 974 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 RRN3Q9NYV6 651 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MARCH2Q9P0N8 246 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.74■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 YJEFN3A6XGL0 299 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 E7ENQ6 273 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SRFP11831 508 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 GBP1P32455 592 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SCNN1AP37088 669 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 VIPR2P41587 438 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SLC6A3Q01959 620 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 EFEMP1Q12805 493 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 PTPN20Q4JDL3 420 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 C11orf70Q9BRQ4 267 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 DCLK3Q9C098 648 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.73■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 DCXO43602 365 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 PRAMEF12O95522 483 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 OLFM2O95897 454 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 GZMAP12544 262 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SKILP12757 684 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 TCF3P15923 654 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CHRNB2P17787 502 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CDC25BP30305 580 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 GDI1P31150 447 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 GABRB2P47870 512 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CDK17Q00537 523 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 AMPD2Q01433 879 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 NR1H3Q13133 447 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MTF1Q14872 753 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 PDGFRLQ15198 375 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 BEND5Q7L4P6 421 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MIB1Q86YT6 1006 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 EDEM1Q92611 657 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SERPINB11Q96P15 392 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 DNAJC7Q99615 494 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 NMUR1Q9HB89 426 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CYTH4Q9UIA0 394 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 DUSP12Q9UNI6 340 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.72■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 TTC28Q96AY4 2481 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 LEFTY2O00292 366 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 CHADO15335 359 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 AKR1B10O60218 316 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ADCY5O95622 1261 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 ERBB2P04626 1255 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 MYBL1P10243 752 aa18.71■□□□□ 0.59
BRF1-209ENST00000547052 IRF1P10914 325 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms