RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 PI4KAP42356 2102 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PQH9 124 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 BICDL2A1A5D9 508 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 KAT7O95251 611 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CD19P15391 556 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 SDHBP21912 280 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TIE1P35590 1138 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PSEN1P49768 467 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 KIF11P52732 1056 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ARHGAP8P85298 464 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 LMNB2Q03252 620 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 KDSRQ06136 332 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CETN1Q12798 172 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TMEM25Q86YD3 366 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 USP33Q8TEY7 942 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 GAB3Q8WWW8 586 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 NELFBQ8WX92 580 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 OSER1Q9NX31 292 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 SPTBN2O15020 2390 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ANTXRLA6NF34 631 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 MDM4O15151 490 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 APBB3O95704 486 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 GRIA2P42262 883 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TNFRSF4P43489 277 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 FMO5P49326 533 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 STX17P56962 302 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CUL2Q13617 745 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 SGO2Q562F6 1265 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 EMC10Q5UCC4 262 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 HTR3DQ70Z44 454 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 KBTBD6Q86V97 674 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PIGZQ86VD9 579 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 C12orf40Q86WS4 652 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 MIB1Q86YT6 1006 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PGBD3Q8N328 593 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 WBP2Q969T9 261 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 SLC35C1Q96A29 364 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CEP63Q96MT8 703 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 BBS2Q9BXC9 721 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 NMUR1Q9HB89 426 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CYLDQ9NQC7 956 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 DEC1Q9P2X7 70 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 HESX1Q9UBX0 185 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 INVSQ9Y283 1065 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 A0A0A0MRY4 1105 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TULP3O75386 442 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ALDH1A2O94788 518 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 HMBSP08397 361 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 GBP1P32455 592 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 TKTL1P51854 596 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 COG7P83436 770 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 EFEMP1Q12805 493 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 MORC3Q14149 939 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms