RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	TCF15	Q12870	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SNX19	Q92543	992 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NEU1	Q99519	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	USP47	Q96K76	1375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	XDH	P47989	1333 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089		E7ENX8	843 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NPC1	O15118	1278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM24	O15164	1050 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TRIAP1	O43715	76 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SUN1	O94901	812 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FGA	P02671	866 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GABRB3	P28472	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CD6	P30203	668 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MAPK9	P45984	424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NPTX2	P47972	431 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF134	P52741	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MC2R	Q01718	297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TAP2	Q03519	686 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	OCA2	Q04671	838 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PLP2	Q04941	152 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GGN	Q86UU5	652 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ADCY9	O60503	1353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ITGB4	P16144	1822 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SYT5	O00445	386 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ACKR2	O00590	384 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	IRAK2	O43187	625 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	USP1	O94782	785 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms