RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531524.5

BSCL2-223, Transcript of BSCL2, seipin lipid droplet biogenesis associated, human

TSL 3

Gene BSCL2, Length 844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BSCL2-223	ENST00000531524	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CYLD	Q9NQC7	956 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	DEC1	Q9P2X7	70 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524		A0A087WV48	116 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524		H3BQV1	296 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CLDN5	O00501	218 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	GCNT3	O95395	438 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TNNC2	P02585	160 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CFI	P05156	583 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	HOXB2	P14652	356 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ANXA13	P27216	316 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ATIC	P31939	592 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF132	P52740	706 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC5A3	P53794	718 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CYP27A1	Q02318	531 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CYP24A1	Q07973	514 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	GRIK2	Q13002	908 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	E2F4	Q16254	413 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	FAM35A	Q86V20	835 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	NAXD	Q8IW45	347 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	FUK	Q8N0W3	1084 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF516	Q92618	1163 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	FOXJ1	Q92949	421 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	FBXO32	Q969P5	355 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	KCNK16	Q96T55	309 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SMO	Q99835	787 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TRIM9	Q9C026	710 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CD93	Q9NPY3	652 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PANK4	Q9NVE7	773 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	OSER1	Q9NX31	292 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	GMIP	Q9P107	970 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CLIC4	Q9Y696	253 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ATM	Q13315	3056 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CKAP5	Q14008	2032 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PTPN13	Q12923	2485 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PTPRB	P23467	1997 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524		A0A1B0GTW7	788 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	METTL12	A8MUP2	240 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	HHLA1	C9JL84	531 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	NPC1	O15118	1278 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TLR5	O60602	858 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	BEST1	O76090	585 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TBX18	O95935	607 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	TYR	P14679	529 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CD6	P30203	668 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	MYL6	P60660	151 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	CUL4A	Q13619	759 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC39A14	Q15043	492 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	PTPRN	Q16849	979 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BSCL2-223	ENST00000531524	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		5.24	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms