RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
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BRMS1-208ENST00000530756 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.49■□□□□ 0.07
BRMS1-208ENST00000530756 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.49■□□□□ 0.07
BRMS1-208ENST00000530756 EHD2Q9NZN4 543 aa15.49■□□□□ 0.07
BRMS1-208ENST00000530756 MTMR6Q9Y217 621 aa15.49■□□□□ 0.07
BRMS1-208ENST00000530756 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.49■□□□□ 0.07
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BRMS1-208ENST00000530756 ARHGAP33O14559 1287 aa15.48■□□□□ 0.07
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BRMS1-208ENST00000530756 KRT82Q9NSB4 513 aa15.48■□□□□ 0.07
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BRMS1-208ENST00000530756 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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BRMS1-208ENST00000530756 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
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BRMS1-208ENST00000530756 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.46■□□□□ 0.07
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BRMS1-208ENST00000530756 ZNF699Q32M78 642 aa15.45■□□□□ 0.06
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BRMS1-208ENST00000530756 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-208ENST00000530756 VRTNQ9H8Y1 702 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-208ENST00000530756 SLC39A2Q9NP94 309 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-208ENST00000530756 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 173.9
BRMS1-208ENST00000530756 MARK1Q9P0L2 795 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-208ENST00000530756 ADAMTS20P59510 1910 aa15.45■□□□□ 0.06
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