RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530202.1

TDRKH-215, Transcript of tudor and KH domain containing, human

TSL 3

Gene TDRKH, Length 477 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TDRKH-215	ENST00000530202	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TDRKH-215	ENST00000530202	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	NR3C1	P04150	777 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	PROS1	P07225	676 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	KRT13	P13646	458 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CMA1	P23946	247 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CHKA	P35790	457 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	NDST1	P52848	882 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CDH8	P55286	799 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	KDSR	Q06136	332 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	INCA1	Q0VD86	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	DCLK3	Q9C098	648 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	GMIP	Q9P107	970 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CHD6	Q8TD26	2715 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202		H0Y626	953 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	KLRC4	O43908	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	STX10	O60499	249 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ADAM23	O75077	832 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	TRIM16	O95361	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	VNN1	O95497	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SYP	P08247	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	RALA	P11233	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	HOXB2	P14652	356 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	BCKDHB	P21953	392 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	GTF2H1	P32780	548 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	VAMP7	P51809	220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SLC8A3	P57103	927 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	IRX4	P78413	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	COG7	P83436	770 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	STK4	Q13043	487 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SMO	Q99835	787 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	KRT37	O76014	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SERPINF2	P08697	491 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	TYR	P14679	529 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	ASPA	P45381	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	DGKG	P49619	791 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CASP4	P49662	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	STARD3	Q14849	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRKH-215	ENST00000530202	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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