RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TECPR2	O15040	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	POM121B	A6NF01	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	INMT	O95050	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PFKM	P08237	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MYF5	P13349	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ENPP1	P22413	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FGFR4	P22455	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KEL	P23276	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	GALNS	P34059	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HOXD12	P35452	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KRT20	P35900	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PRKG1	Q13976	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	STARD3	Q14849	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ESX1	Q8N693	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ABCC11	Q96J66	1382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DTNB	O60941	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TIPRL	O75663	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CKMT1A	P12532	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ELF1	P32519	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ROR1	Q01973	937 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TFF2	Q03403	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TAF12	Q16514	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MED25	Q71SY5	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356		A6NLC8	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	INSIG1	O15503	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	AHCYL1	O43865	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PEX1	O43933	1283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PLOD3	O60568	738 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FGF18	O76093	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms