RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 GNAQP50148 359 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ACLYP53396 1101 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SLC5A3P53794 718 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TFAP4Q01664 338 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 BFSP2Q13515 415 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ACVR2BQ13705 512 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 PPP2R5BQ15173 497 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC96Q2M329 555 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD5Q6N075 450 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB123Q8N688 67 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 IL17DQ8TAD2 202 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CAGE1Q8TC20 777 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 FATE1Q969F0 183 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 HPS3Q969F9 1004 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TIFAQ96CG3 184 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CEP95Q96GE4 821 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TAAR9Q96RI9 348 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.81□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 KIF28PB7ZC32 967 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 CYP2C19P33261 490 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 ARMCX2Q7L311 632 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 SMC5Q8IY18 1101 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 FAM133AQ8N9E0 248 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 REPS2Q8NFH8 660 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 GPR156Q8NFN8 814 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 ANKS1AQ92625 1134 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 KAT5Q92993 513 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RAB24Q969Q5 203 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CDHR1Q96JP9 859 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 RNF146Q9NTX7 359 aa4.8□□□□□ -1.64
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HDAC2-216ENST00000523628 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 INTUQ9ULD6 942 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DNM3Q9UQ16 869 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CUL9Q8IWT3 2517 aa4.8□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.79□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 VSTM5A8MXK1 200 aa4.79□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MAFGO15525 162 aa4.79□□□□□ -1.64
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