RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GAREM1	Q9H706	876 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	NME7	Q9Y5B8	376 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ANK1	P16157	1881 aa		10.02	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	MYH11	P35749	1972 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TRIM24	O15164	1050 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TNFSF14	O43557	240 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GCNT3	O95395	438 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	NCAM1	P13591	858 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TYR	P14679	529 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	BNC1	Q01954	994 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GRIN1	Q05586	938 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	HLA-B	Q31612	363 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	IL21R	Q9HBE5	538 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ITPR1	Q14643	2758 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	MEI4	A8MW99	385 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PCDHGA12	O60330	932 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ATIC	P31939	592 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	DGKG	P49619	791 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CASP5	P51878	434 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC5A3	P53794	718 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	STARD3	Q14849	445 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PTPRN	Q16849	979 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	FUT11	Q495W5	492 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	BRAP	Q7Z569	592 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF276	Q8N554	614 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	WBP2	Q969T9	261 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	KCNK16	Q96T55	309 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GPR174	Q9BXC1	333 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	BBS2	Q9BXC9	721 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CD93	Q9NPY3	652 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CYLD	Q9NQC7	956 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	RAD54B	Q9Y620	910 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ATP8B3	O60423	1300 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	PI4KA	P42356	2102 aa		10	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CAPN8	A6NHC0	703 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263		A8MXQ7	604 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	KCNJ18	B7U540	433 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263		H3BQV1	296 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CLDN5	O00501	218 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TLR5	O60602	858 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	CDK4	P11802	303 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	ABCG1	P45844	678 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TPMT	P51580	245 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	TNNC1	P63316	161 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VIRMA-208	ENST00000523263	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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