RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMFRQ9UKV5 643 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 AP4M1O00189 453 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYT5O00445 386 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 VIPP01282 170 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FGAP02671 866 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CREB1P16220 341 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPPBP16860 134 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFB7P17568 137 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MCM5P33992 734 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTHFSP49914 203 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TPTEP56180 551 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSG6Q00889 435 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPS1Q13098 491 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRM1Q13255 1194 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ST3GAL2Q16842 350 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBC1D5Q92609 795 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUSP26Q9BV47 211 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 AQP12BA6NM10 295 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 QSOX1O00391 747 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDH17O14917 1159 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMPRSS11DO60235 418 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAF5LO75529 589 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1QL1O75973 258 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR47O94967 919 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANXA6P08133 673 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPSP0C0P6 89 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM225BP0DP42 221 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ENGP17813 658 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DRD4P21917 467 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PBX1P40424 430 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAPPC10P48553 1259 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DIO1P49895 249 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DGKQP52824 942 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLE2P56282 527 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEUP1Q05D60 604 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNASE1L3Q13609 305 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 BLMHQ13867 455 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM14Q14142 442 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELF2Q15723 593 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC38Q502W7 563 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCID2Q5JVF3 399 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC174Q6PII3 467 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MORC4Q8TE76 937 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 STYXQ8WUJ0 223 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 REPS1Q96D71 796 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 KAZALD1Q96I82 304 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 UROC1Q96N76 676 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 RMDN3Q96TC7 470 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms