RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 AP4M1O00189 453 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 AREL1O15033 823 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PHKG2P15735 406 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 E2F1Q01094 437 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF543Q08ER8 600 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 FOXF2Q12947 444 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 RNF44Q7L0R7 432 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SNX18Q96RF0 628 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PRR25Q96S07 402 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 AMFRQ9UKV5 643 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 AGLP35573 1532 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 NPATQ14207 1427 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CGB1A6NKQ9 187 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 LINC01548A6NM66 108 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 H7C1Q1 480 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 LATS1O95835 1130 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 FGAP02671 866 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SLC5A1P13866 664 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 LMO1P25800 156 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 MZT2AQ6P582 158 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TERB1Q8NA31 727 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PJA1Q8NG27 643 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 DDB2Q92466 427 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 FAM227BQ96M60 508 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.46□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ABCA6Q8N139 1617 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 PRRT4C9JH25 899 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 PDE8BO95263 885 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 HGFP14210 728 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 CD19P15391 556 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 CASP5P51878 434 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 PGDP52209 483 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 ITGA8P53708 1063 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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PDE4D-220ENST00000512069 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.46□□□□□ -1.54
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PDE4D-220ENST00000512069 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 STRCP1A6NGW2 1772 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.46□□□□□ -1.54
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PDE4D-220ENST00000512069 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 TISP43B9A030 160 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.45□□□□□ -1.54
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PDE4D-220ENST00000512069 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 VPS51Q9UID3 782 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-220ENST00000512069 ANO9A1A5B4 782 aa5.44□□□□□ -1.54
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