RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	MYL4	P12829	197 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PTPN2	P17706	415 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	BMP6	P22004	513 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	CASP1	P29466	404 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	DDIT3	P35638	169 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MTAP	Q13126	283 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MAP7	Q14244	749 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	WSCD1	Q658N2	575 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MYCT1	Q8N699	235 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SMARCD2	Q92925	531 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PSMG2	Q969U7	264 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	RMDN1	Q96DB5	314 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	TCHP	Q9BT92	498 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	BACH2	Q9BYV9	841 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	CEP44	Q9C0F1	390 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	HPS4	Q9NQG7	708 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	CCL26	Q9Y258	94 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	DERA	Q9Y315	318 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	C2CD2	Q9Y426	696 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.94	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	OR6C75	A6NL08	312 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	TGFB1I1	O43294	461 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GNA15	P30679	374 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GDI1	P31150	447 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GRIK1	P39086	918 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	UBA7	P41226	1012 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MCM2	P49736	904 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	ZXDB	P98169	803 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SATB1	Q01826	763 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	TNK2	Q07912	1038 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PLD1	Q13393	1074 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC39A14	Q15043	492 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GAB4	Q2WGN9	574 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	APPL2	Q8NEU8	664 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	HVCN1	Q96D96	273 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	BICD1	Q96G01	975 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	CALML4	Q96GE6	196 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC22A12	Q96S37	553 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	EPC1	Q9H2F5	836 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	ASAH2	Q9NR71	780 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	SPTBN2	O15020	2390 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	MYH10	P35580	1976 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UBE3C-208	ENST00000497368	AKAP13	Q12802	2813 aa		5.93	□□□□□ -1.46

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