RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496910.1

EXOSC3-208, Transcript of exosome component 3, human

TSL 2

Gene EXOSC3, Length 217 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXOSC3-208	ENST00000496910	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	MYO1F	O00160	1098 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	ACTN2	P35609	894 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	FLT3LG	P49771	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	GZMK	P49863	264 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	RABGGTB	P53611	331 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	SLC16A1	P53985	500 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	SP140	Q13342	867 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	GRM7	Q14831	915 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	NFIX	Q14938	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	PSMD6	Q15008	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	KRT40	Q6A162	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	DOK3	Q7L591	496 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	MUL1	Q969V5	352 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EXOSC3-208	ENST00000496910	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910		A0A0B4J269	797 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910		A0A0G2JLW4	131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910		H7C0S8	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF536	O15090	1300 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	ADRB2	P07550	413 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	JUP	P14923	745 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	CCR5	P51681	352 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	NPEPPS	P55786	919 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	TLE1	Q04724	770 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	TLE2	Q04725	743 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	TRPC3	Q13507	836 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	CDSN	Q15517	529 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	CNGA2	Q16280	664 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	RGMA	Q96B86	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EXOSC3-208	ENST00000496910	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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