RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 TRIM66O15016 1216 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 COCHO43405 550 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 KRT19P08727 400 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 PDGFRBP09619 1106 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 JUPP14923 745 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF131P52739 623 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 KIF19Q2TAC6 998 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 FUT11Q495W5 492 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 CXorf38Q8TB03 319 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 FIZ1Q96SL8 496 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 GMIPQ9P107 970 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 CDH9Q9ULB4 789 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 AK5Q9Y6K8 562 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 ADSSP30520 456 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 TPMTP51580 245 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 CLDN6P56747 220 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 STARD3Q14849 445 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 BAP1Q92560 729 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 WBP2Q969T9 261 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 PCED1BQ96HM7 432 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 C8orf48Q96LL4 319 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 SIX4Q9UIU6 781 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-222ENST00000491867 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GFRA2O00451 464 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 KCNK3O14649 394 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CACNG3O60359 315 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 IRF1P10914 325 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ABCD1P33897 745 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CACNA2D1P54289 1103 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 RBP5P82980 135 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 KCNC4Q03721 635 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 SNX19Q92543 992 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 BBS2Q9BXC9 721 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TRIM9Q9C026 710 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 KIF3AQ9Y496 699 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TYRP14679 529 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 YWHAQP27348 245 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 OXTRP30559 389 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 HNF1BP35680 557 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TLE3Q04726 772 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 POSTNQ15063 836 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 HECTD3Q5T447 861 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 MCTP1Q6DN14 999 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHGA12O60330 932 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CCT8P50990 548 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CXADRP78310 365 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms