RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPART	Q8N0X7	666 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	MED30	Q96HR3	178 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	CPA4	Q9UI42	421 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A1W2PPC1	479 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	FYB1	O15117	783 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	GRID2	O43424	1007 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRKAR1B	P31321	381 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	MCM5	P33992	734 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	POLD2	P49005	469 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRIM5	Q9C035	493 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	EPHA3	P29320	983 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	GUCY2F	P51841	1108 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	DEUP1	Q05D60	604 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	LTB	Q06643	244 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	CTBP1	Q13363	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	KATNA1	O75449	491 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM199	Q8N511	208 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARMT1	Q9H993	441 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	FZD4	Q9ULV1	537 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATG13	O75143	517 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	CAMTA2	O94983	1202 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARFIP2	P53365	341 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	GPC5	P78333	572 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	CD93	Q9NPY3	652 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A0G2JK05	382 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM233	B4DJY2	109 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ALDH2	P05091	517 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCND1	P24385	295 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	PTGR1	Q14914	329 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SUCLG1-208	ENST00000491123	SCN5A	Q14524	2016 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	SERINC4	A6NH21	518 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	EXOC5	O00471	708 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	AKAP10	O43572	662 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRGAP2	O75044	1071 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	BTN3A1	O00481	513 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	LINC01565	O15544	149 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	MTHFS	P49914	203 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	GAS1	P54826	345 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	LMO3	Q8TAP4	145 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	DPH1	Q9BZG8	443 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SUCLG1-208	ENST00000491123	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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