RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 SLC7A14Q8TBB6 771 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 RFFLQ8WZ73 363 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 PSMG2Q969U7 264 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 ASIC4Q96FT7 647 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 SLITRK1Q96PX8 696 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 SELENOOQ9BVL4 669 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 APOL5Q9BWW9 433 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 CRISPLD1Q9H336 500 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 TMEM30AQ9NV96 361 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 RRN3Q9NYV6 651 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 ZMYM5Q9UJ78 669 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-211ENST00000488243 TULP2O00295 520 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 HSF2BPO75031 334 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ERBB2P04626 1255 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 KRT3P12035 628 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PFKLP17858 780 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ATF6P18850 670 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP25P42331 645 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 RGS7P49802 495 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 DAOAP59103 153 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ADIGQ0VDE8 80 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TWF1Q12792 350 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ACAP1Q15027 740 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 SNX30Q5VWJ9 437 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 OR6B2Q6IFH4 312 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 OLFML1Q6UWY5 402 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TADA2BQ86TJ2 420 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 SCUBE3Q8IX30 993 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ACRBPQ8NEB7 543 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 VN1R2Q8NFZ6 395 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1524Q8TCG1 905 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 FNIP1Q8TF40 1166 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 THAP2Q9H0W7 228 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 SFXN1Q9H9B4 322 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 MAN1C1Q9NR34 630 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ABCC13Q9NSE7 274 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 CLIC5Q9NZA1 410 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 LCP1P13796 627 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PTPN2P17706 415 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ABCB4P21439 1286 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 RRM1P23921 792 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ID4P47928 161 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 MAMLD1Q13495 774 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 DCUN1D2Q6PH85 259 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TTC9BQ8N6N2 239 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 STKLD1Q8NE28 680 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 FEZF2Q8TBJ5 459 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 FBXO32Q969P5 355 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 DESI2Q9BSY9 194 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ULBP1Q9BZM6 244 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 POPDC2Q9HBU9 364 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 MYO1AQ9UBC5 1043 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TMEM59LQ9UK28 342 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PTPRDP23468 1912 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 CLUHO75153 1309 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PRR23AA6NEV1 266 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ZNF197O14709 1029 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 GABBR2O75899 941 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 LTFP02788 710 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TUBB4AP04350 444 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 RALAP11233 206 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 EPCAMP16422 314 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 CDC25CP30307 473 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 NOS2P35228 1153 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 TUBP50607 506 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 EPHA5P54756 1037 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 MTA1Q13330 715 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 CYP4A22Q5TCH4 519 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 LLGL2Q6P1M3 1020 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 SLC35G2Q8TBE7 412 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-211ENST00000488243 GIPC2Q8TF65 315 aa12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms