RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A1B0GUL7	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR32	O75388	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GNAI3	P08754	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ITPKB	P27987	946 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOLR3	P41439	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAPK10	P53779	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GSTO1	P78417	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MECOM	Q03112	1051 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PICALM	Q13492	652 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTX1	Q13505	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGSF3	O75054	1194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTHFD2	P13995	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDC	P20711	480 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERVK-21	P61565	698 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TFCP2	Q12800	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPP2	Q13103	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDB2	Q92466	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PNKP	Q96T60	521 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MEIS3	Q99687	375 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TIMP4	Q99727	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	YY2	O15391	372 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PROM1	O43490	865 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ENDOD1	O94919	500 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	BAG3	O95817	575 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASNS	P08243	561 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	HMGCS2	P54868	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	BACE1	P56817	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	UROC1	Q96N76	676 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GDF15	Q99988	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYH1	P12882	1939 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A1W2PS29	197 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PEX1	O43933	1283 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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