RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DPP3	Q9NY33	737 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	RLF	Q13129	1914 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A0B4J203	849 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MAP3K13	O43283	966 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	EXTL3	O43909	919 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	E2F6	O75461	281 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MICAL2	O94851	1124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CPE	P16870	476 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP5O	P48047	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC38	Q502W7	563 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	HS1BP3	Q53T59	392 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ARSH	Q5FYA8	562 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DYM	Q7RTS9	669 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DHX58	Q96C10	678 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DYNC1I1	O14576	645 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MGEA5	O60502	916 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CKM	P06732	381 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PLCG1	P19174	1290 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ENPP1	P22413	925 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SYK	P43405	635 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ORC1	Q13415	861 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SNX1	Q13596	522 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	LAMB3	Q13751	1172 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC39A14	Q15043	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PJA1	Q8NG27	643 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	THAP11	Q96EK4	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SENP8	Q96LD8	212 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	UBP1	Q9NZI7	540 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCL16	O15467	120 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	EPCAM	P16422	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF24	P17028	368 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	STARD3	Q14849	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SMARCD2	Q92925	531 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DCLK3	Q9C098	648 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TASP1	Q9H6P5	420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	OGFR	Q9NZT2	677 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ENC1	O14682	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ECI2	O75521	394 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	RHOBTB1	O94844	696 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	THEGL	P0DJG4	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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