RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480447.5

NOP56-212, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 651 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-212ENST00000480447 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SNX25Q9H3E2 840 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 HPS4Q9NQG7 708 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PANK4Q9NVE7 773 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 INTS13Q9NVM9 706 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 COMMD8Q9NX08 183 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 L1RE1Q9UN81 338 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CCL26Q9Y258 94 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ATP8B3O60423 1300 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CITO14578 2027 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 A0A1W2PNR3 127 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 EGFP01133 1207 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 P4HA1P13674 534 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CEACAM1P13688 526 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GRIA2P42262 883 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CUL4AQ13619 759 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DMC1Q14565 340 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SLC39A14Q15043 492 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ZNF77Q15935 545 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 RNF43Q68DV7 783 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 XKR5Q6UX68 686 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 KBTBD6Q86V97 674 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CEP76Q8TAP6 659 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MMS19Q96T76 1030 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PKMYT1Q99640 499 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 NCANO14594 1321 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 UBE4BO95155 1302 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 E2F8A0AVK6 867 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 KCNK5O95279 499 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 APODP05090 189 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ARSAP15289 507 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 EPB42P16452 691 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TNNI1P19237 187 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PMLP29590 882 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GNA15P30679 374 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GBP1P32455 592 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TUBP50607 506 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TNNC1P63316 161 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CYP27A1Q02318 531 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CREB5Q02930 508 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TYRO3Q06418 890 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TRPC3Q13507 836 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 EOGTQ5NDL2 527 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ATL3Q6DD88 541 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 RASSF3Q86WH2 238 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CXorf38Q8TB03 319 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 WHAMMQ8TF30 809 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SAAL1Q96ER3 474 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TNIP3Q96KP6 325 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms