RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 THAP12O43422 761 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 MED7O43513 233 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 GREM1O60565 184 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 LCP1P13796 627 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 GJA4P35212 333 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CLCN1P35523 988 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 PTPN5P54829 565 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.111e-10■□□□□ 9.7
ACTB-211ENST00000480301 PON2Q15165 354 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 C10orf120Q5SQS8 335 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CNGB3Q9NQW8 809 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1HO95180 2353 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 TPM2P07951 284 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CHRNB1P11230 501 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 UCHL3P15374 230 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA9P43362 315 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 KLK7P49862 253 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 DAOAP59103 153 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SYCE3A1L190 88 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 E7ENQ6 273 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 PIK3R2O00459 728 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 NFATC1O95644 943 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 IRF1P10914 325 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 ATP1A3P13637 1013 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 NR1H3Q13133 447 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 HTR3DQ70Z44 454 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 GANQ9H2C0 597 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 H0Y858 1186 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CYP17A1P05093 508 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 ZNF165P49910 485 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 AMPD2Q01433 879 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 PTK2Q05397 1052 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 DHCR24Q15392 516 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 GAB4Q2WGN9 574 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 STK32AQ8WU08 396 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 OTUB2Q96DC9 234 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 STK33Q9BYT3 514 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SMTNL1A8MU46 457 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 LGALS16A8MUM7 142 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 GALK1P51570 392 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 EFEMP1Q12805 493 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CCINQ13939 588 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 IQCB1Q15051 598 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 ANGPT1Q15389 498 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 MIB1Q86YT6 1006 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 IRGQQ8WZA9 623 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CHRDQ9H2X0 955 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 EPHB6O15197 1021 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 FBXO21O94952 628 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 LRRC32Q14392 662 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 TMEM110Q86TL2 294 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 EDEM1Q92611 657 aa21.95■■□□□ 1.1
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