RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478196.6

RPS27A-208, Transcript of ribosomal protein S27a, human

TSL 2

Gene RPS27A, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CYTH3	O43739	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ITGA10	O75578	1167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GAST	P01350	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MCM5	P33992	734 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC16A2	P36021	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC1A4	P43007	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CHN2	P52757	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	EVC	P57679	992 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SNAP25	P60880	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TRDN	Q13061	729 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GRM4	Q14833	912 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ELANE	P08246	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	HOXC6	P09630	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	JMJD7	P0C870	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MAPK4	P31152	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FLT3LG	P49771	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	STAT2	P52630	851 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	OAZ1	P54368	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	OCA2	Q04671	838 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GRB14	Q14449	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KRT32	Q14532	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	WTAP	Q15007	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	NID2	Q14112	1375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PJA2	O43164	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ICAM1	P05362	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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