RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 BBOF1Q8ND07 529 aa6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ATL2Q8NHH9 583 aa6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 UBA3Q8TBC4 463 aa6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HAPLN3Q96S86 360 aa6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 APOL6Q9BWW8 343 aa6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 KRT82Q9NSB4 513 aa6.74□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.73□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 E7ESA3 106 aa6.73□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 ATP2C2O75185 946 aa6.73□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 NUDT17P0C025 328 aa6.73□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 DR1Q01658 176 aa6.73□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 RAB33AQ14088 237 aa6.73□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 SLC14A2Q15849 920 aa6.73□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 TEX35Q5T0J7 233 aa6.73□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.73□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.73□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 COL4A2P08572 1712 aa6.73□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 ALDH2P05091 517 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRKCI-202ENST00000476635 RALAP11233 206 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 DESP17661 470 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 ITGB8P26012 769 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 CETN2P41208 172 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 MAGEA3P43357 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 BRCC3P46736 316 aa6.72□□□□□ -1.33
PRKCI-202ENST00000476635 GLUD2P49448 558 aa6.72□□□□□ -1.33
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