RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475330.1

CBX1P5-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P5, Length 559 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P5-201ENST00000475330 H3BML4 177 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 BAG3O95817 575 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 HLA-DOAP06340 250 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CFPP27918 469 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 SREBF1P36956 1147 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 NT5C2P49902 561 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 EVCP57679 992 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ADAM8P78325 824 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 BEX3Q00994 111 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 TTC7BQ86TV6 843 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 MB21D1Q8N884 522 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 SYT8Q8NBV8 401 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 REPS2Q8NFH8 660 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CFHR4Q92496 578 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 RABGGTAQ92696 567 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 RGMAQ96B86 450 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 TMX3Q96JJ7 454 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 GPHA2Q96T91 129 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 KCNH6Q9H252 994 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 HIPK3Q9H422 1215 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 LDAHQ9H6V9 325 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CACNA1HO95180 2353 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 TRIM13O60858 407 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 FLOT1O75955 427 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 MBD4O95243 580 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC25A27O95847 323 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 FGAP02671 866 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ALADP13716 330 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PTMSP20962 102 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PTPN7P35236 360 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CASRP41180 1078 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 IL12RB1P42701 662 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 AK2P54819 239 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 NPEPPSP55786 919 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 DSC2Q02487 901 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 GABPAQ06546 454 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CCDC157Q569K6 752 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PRSS33Q8NF86 280 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 NEK1Q96PY6 1258 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 TMEM140Q9NV12 185 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 USP34Q70CQ2 3546 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 MYO7AQ13402 2215 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 A0A1W2PRX2 142 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 DBX1A6NMT0 343 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 E7EWF7 191 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC16A6O15403 523 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 DCXO43602 365 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 GPR32O75388 356 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ALDH2P05091 517 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 MYL1P05976 194 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 RIN1Q13671 783 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ITGA7Q13683 1181 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 ACVR2BQ13705 512 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 KCTD2Q14681 263 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 SURF1Q15526 300 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1P5-201ENST00000475330 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms