RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PEX13	Q92968	403 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ART5	Q96L15	291 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TESK2	Q96S53	571 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	BBS2	Q9BXC9	721 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM4	Q9C037	500 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TASP1	Q9H6P5	420 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	UCK1	Q9HA47	277 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	IL37	Q9NZH6	218 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	POLK	Q9UBT6	870 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	HCN2	Q9UL51	889 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GAB2	Q9UQC2	676 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MYPN	Q86TC9	1320 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	APOL1	O14791	398 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CLDN3	O15551	220 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CACNG3	O60359	315 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CBR3	O75828	277 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GNA14	O95837	355 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	HLA-DRA	P01903	254 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	UQCRH	P07919	91 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ACADM	P11310	421 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ODC1	P11926	461 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CPA1	P15085	419 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CKMT2	P17540	419 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TYMP	P19971	482 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CTNNA2	P26232	953 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ADSS	P30520	456 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ACADSB	P45954	432 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MAPKAPK2	P49137	400 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PRKAA2	P54646	552 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	OXCT1	P55809	520 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FOXO4	P98177	505 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	OCRL	Q01968	901 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KRT17	Q04695	432 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	STIM1	Q13586	685 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SGO2	Q562F6	1265 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FIGN	Q5HY92	759 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	USP49	Q70CQ1	688 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PXK	Q7Z7A4	578 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	COMTD1	Q86VU5	262 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SESTD1	Q86VW0	696 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DPP10	Q8N608	796 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TSPYL6	Q8N831	410 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	WNT8B	Q93098	351 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	COX16	Q9P0S2	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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