RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470243.5

SRRM1-208, Transcript of serine and arginine repetitive matrix 1, human

TSL 5

Gene SRRM1, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM1-208	ENST00000470243	SYT5	O00445	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ACKR2	O00590	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PLSCR1	O15162	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	KCNQ3	O43525	872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	RGS10	O43665	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	LPXN	O60711	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	CDKL5	O76039	1030 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SPDEF	O95238	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PDHA1	P08559	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	C1S	P09871	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PPP3CB	P16298	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	EGR1	P18146	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	GATA3	P23771	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ADORA2A	P29274	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ATIC	P31939	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	GRK6	P43250	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SP2	Q02086	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	IDI1	Q13907	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	CCT6B	Q92526	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	NELL2	Q99435	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ASNA1	O43681	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	HGF	P14210	728 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	IDE	P14735	1019 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF20	P17024	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	MST1	P26927	711 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ZXDA	P98168	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243		E9PCH4	1651 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	TRIAP1	O43715	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	ERBB2	P04626	1255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	NTSR1	P30989	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	PDE6C	P51160	858 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	SCAP	Q12770	1279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRRM1-208	ENST00000470243	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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