RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 BAIAP3O94812 1187 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 TJP3O95049 919 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CD48P09326 243 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 USP17L7P0C7H9 530 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ACRP10323 421 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 DESP17661 470 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CYP2F1P24903 491 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 NOS2P35228 1153 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 MAGEA11P43364 429 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SULT1E1P49888 294 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 TRADDQ15628 312 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CCNG2Q16589 344 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 BOLA3Q53S33 107 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 BBS12Q6ZW61 710 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CEP57Q86XR8 500 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 HOMEZQ8IX15 550 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 HSPH1Q92598 858 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 C8orf48Q96LL4 319 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 IL23AQ9NPF7 189 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.96□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 MDM4O15151 490 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 VNN2O95498 520 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 LTFP02788 710 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ECHS1P30084 290 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 GRIK1P39086 918 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 KCNJ1P48048 391 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SLC5A3P53794 718 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 GPR17Q13304 367 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 DPYSL3Q14195 570 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 PDK2Q15119 407 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CA9Q16790 459 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 MAP9Q49MG5 647 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 DCAF6Q58WW2 860 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ODF2Q5BJF6 829 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 KAZNQ674X7 775 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 DUPD1Q68J44 220 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 VSTM1Q6UX27 236 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 BEND5Q7L4P6 421 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 VSIG1Q86XK7 387 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 KCTD6Q8NC69 237 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 FAF2Q96CS3 445 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 IGSF21Q96ID5 467 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ERP44Q9BS26 406 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 TTPALQ9BTX7 342 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 FUT8Q9BYC5 575 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 RAB17Q9H0T7 212 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.95□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 MTMR11A4FU01 709 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF487B1APH4 448 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ATP8B1O43520 1251 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 LIASO43766 372 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CST8O60676 142 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SASH3O75995 380 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SLC34A2O95436 690 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ECEL1O95672 775 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 IL4RP24394 825 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 GPR15P49685 360 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 EPHB4P54760 987 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CDH6P55285 790 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SMARCB1Q12824 385 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 MMRN1Q13201 1228 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 SNX1Q13596 522 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 CUL1Q13616 776 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 DPYSL2Q16555 572 aa9.94□□□□□ -0.82
SRPRB-202ENST00000466636 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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