RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 NFKBIBQ15653 356 aa4.48□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.48□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 GAB4Q2WGN9 574 aa4.48□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC181Q5TID7 509 aa4.48□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.48□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 FUT10Q6P4F1 479 aa4.48□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.48□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.48□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.48□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 INVSQ9Y283 1065 aa4.48□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 M0R2C6 588 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB5O15062 677 aa4.47□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEB2O15479 319 aa4.47□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 OPA1O60313 960 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 BRINP1O60477 761 aa4.47□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 CBX7O95931 251 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 POMCP01189 267 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SYPP08247 313 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINF2P08697 491 aa4.47□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 VAV1P15498 845 aa4.47□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 VIPR2P41587 438 aa4.47□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 CYP27A1Q02318 531 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SEMG2Q02383 582 aa4.47□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 PTPAQ15257 358 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC184Q52MB2 194 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 RTP2Q5QGT7 225 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SYT13Q7L8C5 426 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CD163Q86VB7 1156 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 MARCH9Q86YJ5 346 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TCTN2Q96GX1 697 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SDF4Q9BRK5 362 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM74BQ9NUR3 256 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 U3KQE9 123 aa4.47□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
ECHDC1-211ENST00000460558 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 SDK2Q58EX2 2172 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 MYH10P35580 1976 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 ANK1P16157 1881 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 HMX2A2RU54 273 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM149AA5PLN7 773 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 PLK4O00444 970 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR39O43194 453 aa4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
ECHDC1-211ENST00000460558 LRG1P02750 347 aa4.46□□□□□ -1.7
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