RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460330.5

PTGER3-209, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 1,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-209ENST00000460330 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.19■□□□□ 0.82
PTGER3-209ENST00000460330 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 MDM4O15151 490 aa20.18■□□□□ 0.82
PTGER3-209ENST00000460330 ERBB2P04626 1255 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 TCF3P15923 654 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 ASIC2Q16515 512 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 C2CD6Q53TS8 623 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 WBP2Q969T9 261 aa20.15■□□□□ 0.82
PTGER3-209ENST00000460330 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.15■□□□□ 0.82
PTGER3-209ENST00000460330 C18orf8Q96DM3 657 aa20.15■□□□□ 0.82
PTGER3-209ENST00000460330 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.15■□□□□ 0.82
PTGER3-209ENST00000460330 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTGER3-209ENST00000460330 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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PTGER3-209ENST00000460330 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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PTGER3-209ENST00000460330 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 RNF139Q8WU17 664 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTGER3-209ENST00000460330 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.14■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTGER3-209ENST00000460330 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.14■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 IRF1P10914 325 aa20.13■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 NCAM1P13591 858 aa20.13■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 TNFAIP3P21580 790 aa20.13■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 MMP8P22894 467 aa20.13■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 PFKPQ01813 784 aa20.13■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 SLC6A3Q01959 620 aa20.13■□□□□ 0.81
PTGER3-209ENST00000460330 CENPCQ03188 943 aa20.13■□□□□ 0.81
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