RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 GRAMD4Q6IC98 578 aa27.88■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 RABEPKQ7Z6M1 372 aa27.88■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM174Q8WUU8 243 aa27.88■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.88■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa27.88■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 HCN2Q9UL51 889 aa27.88■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 VNN1O95497 513 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CFIP05156 583 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 SEMA3BQ13214 749 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CUL4BQ13620 913 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 UNC93AQ86WB7 457 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 SLC9A9Q8IVB4 645 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CRYBG2Q8N1P7 616 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 SLC2A14Q8TDB8 520 aa27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 MYH10P35580 1976 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PQF6 199 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CACNG3O60359 315 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF217O75362 1048 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 BEST1O76090 585 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 RPN1P04843 607 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC130P13994 396 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 GOLGA8FQ08AF8 430 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 SDE2Q6IQ49 451 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 PIP4P1Q86T03 277 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 MIB1Q86YT6 1006 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 TAF4BQ92750 862 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 GATA6Q92908 595 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CYLDQ9NQC7 956 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 DMAC2Q9NW81 257 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 MARK1Q9P0L2 795 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 WDR35Q9P2L0 1181 aa27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM24O15164 1050 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 GREM1O60565 184 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 SERPINF2P08697 491 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 AFMP43652 599 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 PGFP49763 221 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 NDST1P52848 882 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 MAP3K7CLP57077 242 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF33AQ06730 810 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ZACNQ401N2 412 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CHPFQ8IZ52 775 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 HDDC3Q8N4P3 179 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ELMO3Q96BJ8 720 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 BBS2Q9BXC9 721 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CAPN10Q9HC96 672 aa27.85■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 TYRP14679 529 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 WASP42768 502 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 GABRG3Q99928 467 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CD248Q9HCU0 757 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 HMGXB4Q9UGU5 601 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa27.84■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 PCDH15Q96QU1 1955 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 TBX18O95935 607 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 FAM200BP0CF97 657 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 DLG4P78352 724 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 ORC1Q13415 861 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 RESP18Q5W5W9 173 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 CEP57L1Q8IYX8 460 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 FAM49BQ9NUQ9 324 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 SCML2Q9UQR0 700 aa27.83■■■□□ 2.05
PBRM1-218ENST00000458294 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 KLRC4O43908 158 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFV2P19404 249 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 ME1P48163 572 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 KLHDC10Q6PID8 442 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 DEFB119Q8N690 84 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 C12orf29Q8N999 325 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA0895Q8NCT3 520 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 TMC2Q8TDI7 906 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 ACOX2Q99424 681 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 FSCN3Q9NQT6 498 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 GON4LQ3T8J9 2241 aa27.82■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 OPHN1O60890 802 aa27.81■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 ASS1P00966 412 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 ASPAP45381 313 aa27.81■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PBRM1-218ENST00000458294 STK4Q13043 487 aa27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms