RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ERAP2Q6P179 960 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NEURL2Q9BR09 285 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DRC3Q9H069 523 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF19AQ9NV58 838 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX13Q9UN79 622 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3CDO00329 1044 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EDIL3O43854 480 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ENTPD3O75355 529 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TGDSO95455 350 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 THRAP10827 490 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDX5P30044 214 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH1A3P47895 512 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP1A4Q13733 1029 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SPIDRQ14159 915 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PDK1Q15118 436 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CYTH1Q15438 398 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BORAQ6PGQ7 559 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BBOF1Q8ND07 529 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RILPQ96NA2 401 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PLVAPQ9BX97 442 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 IDI2Q9BXS1 227 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9H521 79 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP14Q460N5 1801 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KAT6AQ92794 2004 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 LPXNO60711 386 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ECE1P42892 770 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FMO5P49326 533 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A3P53794 718 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4A11Q02928 519 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 APOFQ13790 326 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF6Q58WW2 860 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MICALL2Q8IY33 904 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 AHI1Q8N157 1196 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DDI1Q8WTU0 396 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MBOAT7Q96N66 472 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PLK2Q9NYY3 685 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ASTN1O14525 1302 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EPI3 171 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PDXKO00764 312 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TM9SF1O15321 606 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD3B2P26439 372 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CPOXP36551 454 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PHKA2P46019 1235 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MTM1Q13496 603 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD6Q15008 389 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 HYIQ5T013 277 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 OGFOD2Q6N063 350 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms