RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A087WWL8 130 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 FYB1O15117 783 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 POU2F2P09086 479 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MLH1P40692 756 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MTHFSP49914 203 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ENTPD1P49961 510 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 GAS1P54826 345 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TIRAPP58753 221 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PTPN21Q16825 1174 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PGS1Q32NB8 556 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 NPNTQ6UXI9 565 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 CD93Q9NPY3 652 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 CPA4Q9UI42 421 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 CCND1P24385 295 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 UQCRC1P31930 480 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MTMR1Q13613 665 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 NUAK2Q9H093 628 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.68□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PPC1 479 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 RRHO14718 337 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 AKAP10O43572 662 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 USP12O75317 370 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF432O94892 652 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.67□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 F8W810 466 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 CGAP01215 116 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNJ4P48050 445 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 FCRL5Q96RD9 977 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM5Q9C035 493 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ARMT1Q9H993 441 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 USP29Q9HBJ7 922 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 FZD4Q9ULV1 537 aa4.66□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 EXOC5O00471 708 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CLSTN1O94985 981 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 RHCEP18577 417 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 MCM5P33992 734 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 GUCY2FP51841 1108 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC12A2P55011 1212 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP10-12P60413 245 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 DEUP1Q05D60 604 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CTBP1Q13363 440 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 LMO3Q8TAP4 145 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 MTMR8Q96EF0 704 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 FZD3Q9NPG1 666 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 WNT16Q9UBV4 365 aa4.65□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 GPC5P78333 572 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 EGR4Q05215 589 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 KRT71Q3SY84 523 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SDE2Q6IQ49 451 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TNKSO95271 1327 aa4.64□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 RGS10O43665 173 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SRGAP2O75044 1071 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ATG13O75143 517 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms