RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TLK2Q86UE8 772 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KRT87PA6NCN2 255 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PDHXO00330 501 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 BCL10O95999 233 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 APOA4P06727 396 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PEX5P50542 639 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 JADE3Q92613 823 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SEPHS2Q99611 448 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 STK25O00506 426 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NCAM1P13591 858 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AGKQ53H12 422 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RDM1Q8NG50 284 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 STK32AQ8WU08 396 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SELENONQ9NZV5 590 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MED24O75448 989 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GUCA1CO95843 209 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AMHR2Q16671 573 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC5A5Q92911 643 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CDCA5Q96FF9 252 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SPASTQ9UBP0 616 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PTENP60484 403 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KYAT1Q16773 422 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RNF180Q86T96 592 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TMX2Q9Y320 296 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF682O95780 498 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CPA3P15088 417 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RGS4P49798 205 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DGKDQ16760 1214 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CYP51A1Q16850 503 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TTMPQ5BVD1 217 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF333Q96JL9 665 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MPP6Q9NZW5 540 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 YY1P25490 414 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 IL5RAQ01344 420 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CHSY1Q86X52 802 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MUC3BQ9H195 1237 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SOAT2O75908 522 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 BAIAP3O94812 1187 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FDFT1P37268 417 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FIGNQ5HY92 759 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 INTS13Q9NVM9 706 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RNF112Q9ULX5 631 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TBX20Q9UMR3 447 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PIK3CDO00329 1044 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TM9SF1O15321 606 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF862O60290 1169 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FSBPO95073 299 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ITGB3P05106 788 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CYP2C9P11712 490 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TROAPQ12815 778 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TP53BP2Q13625 1128 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AGAP11Q8TF27 550 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 WWOXQ9NZC7 414 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 C2CD2Q9Y426 696 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms