RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYADML2A6NDP7 307 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNN4O15554 427 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKR1A1P14550 325 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT15P19012 456 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WARSP23381 471 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRPAP1P30533 357 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 L1CAMP32004 1257 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNL1Q8IU54 200 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGSM3Q96HU1 749 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP42Q96MM3 310 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRABDQ9H4I3 376 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SENP1Q9P0U3 644 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAK5Q9P286 719 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP69A5D8W1 941 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHADO15335 359 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP2F1P24903 491 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSS3Q9H6R3 686 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF9Q9HAQ2 790 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP4E1Q9UPM8 1137 aa19.47■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K6O95382 1288 aa19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBED1O96006 694 aa19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBL1P28749 1068 aa19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUKQ8N0W3 1084 aa19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCT6BQ92526 530 aa19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB18Q96M61 343 aa19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX3O60493 162 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP2C2O75185 946 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSHRP16473 764 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRED3Q2MJR0 410 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM182AQ5T1J6 154 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUGGCQ68CJ6 796 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIGZQ86VD9 579 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PALM2Q8IXS6 379 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBF1Q8TES7 1133 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB6BQ9NRW1 208 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP2BQ9UQN3 213 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN7Q9Y6W3 813 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPAG7O75391 227 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OAS1P00973 400 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC18A1P54219 525 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR4P57081 412 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADIGQ0VDE8 80 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL38Q2WGJ6 581 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFHC1Q5JVL4 640 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC185Q8N715 623 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPV1Q8NER1 839 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMC6Q96SB8 1091 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHRS4Q9BTZ2 278 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP16Q9BY84 665 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB5Q9BZ81 275 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.45■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEIS3P2A8K0S8 358 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0QZ92 97 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYB561D2O14569 222 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN15O75808 1086 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELK3P41970 407 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MATKP42679 507 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYCP2LQ5T4T6 812 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STRADAQ7RTN6 431 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGDCC3Q8IVU1 814 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf33Q8N1A6 199 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAFAH2Q99487 392 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM4CQ9H3R0 1056 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCT8L1PA6NM43 557 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTGFP29279 349 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC8A3P57103 927 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WSCD1Q658N2 575 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRD1Q6QNK2 874 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DENND1AQ8TEH3 1009 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX264Q9Y6I9 313 aa19.44■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PPM1 405 aa19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms