RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYH10P35580 1976 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQF6 199 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM24O15164 1050 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLR5O60602 858 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOC3O60645 756 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP1P29466 404 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASP42768 502 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP3M2P53677 418 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF33AQ06730 810 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCOA4Q13772 614 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRAMD4Q6IC98 578 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHC4Q6S5L8 630 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIB1Q86YT6 1006 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDDC3Q8N4P3 179 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMOQ99835 787 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDCBP2Q9H190 292 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLZF1Q9H2G9 400 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN10Q9HC96 672 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GON4LQ3T8J9 2241 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNG3O60359 315 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GREM1O60565 184 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUTAO60888 179 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPHN1O60890 802 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINF2P08697 491 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC130P13994 396 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR3DQ70Z44 454 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACOT1Q86TX2 421 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB119Q8N690 84 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELMO3Q96BJ8 720 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD248Q9HCU0 757 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.93□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA1EQ15878 2313 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCNX2A6NKB5 2137 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF217O75362 1048 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEST1O76090 585 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VNN1O95497 513 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YEATS4O95619 227 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFV2P19404 249 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGFP49763 221 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN10P78369 228 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ORC1Q13415 861 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHPFQ8IZ52 775 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MINDY1Q8N5J2 469 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA5Q8TBA6 731 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARD3BQ8TEW8 1205 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACOX2Q99424 681 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRG3Q99928 467 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBS2Q9BXC9 721 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARK1Q9P0L2 795 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGXB4Q9UGU5 601 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK13Q9UKR3 277 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP8B1Q9UNU6 501 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSRB2Q9Y3D2 182 aa13.92□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA1GO43497 2377 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBX18O95935 607 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P4HA1P13674 534 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYRP14679 529 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K7CLP57077 242 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUL4BQ13620 913 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDE2Q6IQ49 451 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA12BQ96MM6 686 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYLDQ9NQC7 956 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM49BQ9NUQ9 324 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKD1L2Q7Z442 2459 aa13.91□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms