RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 BANF1O75531 89 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 WFS1O76024 890 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 RGS2P41220 211 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ2P63252 427 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A3Q01959 620 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SLC18A2Q05940 514 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CCDC14Q49A88 953 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 FYB2Q5VWT5 728 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CAPN12Q6ZSI9 719 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SESTD1Q86VW0 696 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZNF276Q8N554 614 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 PLD5Q8N7P1 536 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 C10orf82Q8WW14 230 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 LRMDAQ9H2I8 198 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 C2CD2LO14523 706 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 KRT81Q14533 505 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TRIB2Q92519 343 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TINF2Q9BSI4 451 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 GGT7Q9UJ14 662 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZNF180Q9UJW8 692 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 APOL1O14791 398 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 DHRS4L1P0CG22 281 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 IL4RP24394 825 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ELK3P41970 407 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 RASSF2P50749 326 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 MCUQ8NE86 351 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 H7C0C1 242 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 MT-ND3P03897 115 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CCND1P24385 295 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SDC4P31431 198 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 PTPN9P43378 593 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ATP5OP48047 213 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 MMRN1Q13201 1228 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 NLRP7Q8WX94 980 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 KIF12Q96FN5 646 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SAR1AQ9NR31 198 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CHKBQ9Y259 395 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TGDSO95455 350 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 VTNP04004 478 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TRIM32Q13049 653 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 OTOAQ7RTW8 1153 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 KLC2Q9H0B6 622 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CITO14578 2027 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 H3BRB1 525 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ELNP15502 786 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 BCAR1P56945 870 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB6Q15916 424 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SH2D5Q6ZV89 423 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 PQLC3Q8N755 202 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TCP10LQ8TDR4 215 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.558e-10■■□□□ 12.3
PMS1-205ENST00000409985 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 EBF2Q9HAK2 575 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 HESX1Q9UBX0 185 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 INHBAP08476 426 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 KRT16P08779 473 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 NR2C2P49116 596 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 NEK3P51956 506 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 LBX1P52954 281 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 NPNTQ6UXI9 565 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
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