RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393033.8

GIPC1-203, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-203ENST00000393033 MGARPQ8TDB4 240 aa27.39■■□□□ 1.98
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GIPC1-203ENST00000393033 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa27.39■■□□□ 1.98
GIPC1-203ENST00000393033 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
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GIPC1-203ENST00000393033 ITIH4Q14624 930 aa27.39■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 FUKQ8N0W3 1084 aa27.39■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 ANKRD42Q8N9B4 389 aa27.39■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.39■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
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GIPC1-203ENST00000393033 ZFP42Q96MM3 310 aa27.38■■□□□ 1.97
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GIPC1-203ENST00000393033 HEY1Q9Y5J3 304 aa27.38■■□□□ 1.97
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GIPC1-203ENST00000393033 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
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GIPC1-203ENST00000393033 SLC8A3P57103 927 aa27.37■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 XRCC4Q13426 336 aa27.37■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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GIPC1-203ENST00000393033 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 KRT15P19012 456 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 ADGRD1Q6QNK2 874 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 RPAINQ86UA6 219 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 TAX1BP1Q86VP1 789 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-203ENST00000393033 CCDC185Q8N715 623 aa27.34■■□□□ 1.97
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