RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 BNIP1Q12981 228 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TCEAL1Q15170 157 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RCN1Q15293 331 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 OLIG1Q8TAK6 271 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RNF157Q96PX1 679 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 WWP1Q9H0M0 922 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 VCXQ9H320 206 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ASB7Q9H672 318 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 STARD13Q9Y3M8 1113 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ICAM3P32942 547 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SLC26A2P50443 739 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 DEUP1Q05D60 604 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 STILQ15468 1287 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RPAINQ86UA6 219 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TTC39CQ8N584 583 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 UBP1Q9NZI7 540 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 BFARQ9NZS9 450 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 NEMP1O14524 444 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 B4GALT4O60513 344 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SPAG6O75602 509 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ADORA2AP29274 412 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 PDK2Q15119 407 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 GRIK4Q16099 956 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RNF43Q68DV7 783 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 CDCA5Q96FF9 252 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SLC5A4Q9NY91 659 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SCN9AQ15858 1988 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 WDR27A2RRH5 827 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 MAP3K7O43318 606 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ASMTLO95671 621 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ATICP31939 592 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SNAPC2Q13487 334 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RASA2Q15283 850 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 APOPT1Q96IL0 206 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TNIP3Q96KP6 325 aa10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 FCHO1O14526 889 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TM9SF1O15321 606 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 STBD1O95210 358 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SKIP12755 728 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 KCNA4P22459 653 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 GBE1Q04446 702 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ASPHQ12797 758 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 GPR162Q16538 588 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 WDTC1Q8N5D0 677 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 CCNYL1Q8N7R7 359 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 NLGN2Q8NFZ4 835 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SMAPO00193 183 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 OPHN1O60890 802 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 CILPO75339 1184 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TPI1P60174 286 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SLC6A3Q01959 620 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 CCL15Q16663 113 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RAB6CQ53S08 254 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 PMF1Q6P1K2 205 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 GPC2Q8N158 579 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SLC25A41Q8N5S1 370 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SLC35B2Q8TB61 432 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 C12orf42Q96LP6 360 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF560Q96MR9 790 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 RAB6CQ9H0N0 254 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 SLC12A4Q9UP95 1085 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 CHKBQ9Y259 395 aa10.98□□□□□ -0.65
ZNF549-202ENST00000376233 PIGRP01833 764 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms