RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 DERAQ9Y315 318 aa13.92□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 M0QYT0 321 aa13.92□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PIRO00625 290 aa13.92□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 SPAG7O75391 227 aa13.92□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.92□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 TUSC3Q13454 348 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 KDM7AQ6ZMT4 941 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 NLRP14Q86W24 1093 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 CTAGE3PQ8IX95 158 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 DEFB106AQ8N104 65 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PCED1BQ96HM7 432 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 TMEM209Q96SK2 561 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 BEST1O76090 585 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 MAGEA4P43358 317 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 TAOK1Q7L7X3 1001 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 MAP7D3Q8IWC1 876 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 ART4Q93070 314 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 LIASO43766 372 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 NEBLO76041 1014 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 HMBSP08397 361 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 KCNE1P15382 129 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 TRIM60Q495X7 471 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 LHX8Q68G74 356 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 CNPY3Q9BT09 278 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 GGT7Q9UJ14 662 aa13.91□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 SOAT2O75908 522 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 KDELR1P24390 212 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 SLC6A3Q01959 620 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 CASC4Q6P4E1 433 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 UNC93AQ86WB7 457 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 MYLPFQ96A32 169 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 DDIT4Q9NX09 232 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 WHRNQ9P202 907 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 GOLGA8RI6L899 631 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 KCNN4O15554 427 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 SRGAP2BP0DMP2 458 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 NPR3P17342 541 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 LHX1P48742 406 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 BBOF1Q8ND07 529 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 LHX5Q9H2C1 402 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 H0YGN5 161 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 ZBED1O96006 694 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 ACRP10323 421 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 CREB1P16220 341 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 FUKQ8N0W3 1084 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 30.8
HCN3-201ENST00000368358 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 NFS1Q9Y697 457 aa13.9□□□□□ -0.18
HCN3-201ENST00000368358 WDR91A4D1P6 747 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 GMNCA6NCL1 334 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 RASA4BC9J798 803 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 RASA4O43374 803 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 BRAFP15056 766 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 CYP2F1P24903 491 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 STX2P32856 288 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 DRG2P55039 364 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 ZBTB6Q15916 424 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 FAF2Q96CS3 445 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 FAM169AQ9Y6X4 670 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 ALDH2P05091 517 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 RAG1P15918 1043 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 ARL4AP40617 200 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 CDKN2BP42772 138 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 VCPP55072 806 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 DEUP1Q05D60 604 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 INCA1Q0VD86 236 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 GRIK3Q13003 919 aa13.89□□□□□ -0.19
HCN3-201ENST00000368358 PTK6Q13882 451 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms