RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 RHOAP61586 193 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 AMPD2Q01433 879 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ADCY2Q08462 1091 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 EML3Q32P44 896 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 LPPQ93052 612 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAR2Q96K12 515 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PANX2Q96RD6 677 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAM25AB3EWG3 89 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAM25CB3EWG5 89 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FAM25GB3EWG6 89 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TEX46H3BTG2 121 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CDC25BP30305 580 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 GPR1P46091 355 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RGS4P49798 205 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 POU4F1Q01851 419 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DMPKQ09013 629 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PRKAA1Q13131 559 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KYNUQ16719 465 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF544Q6NX49 715 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SGF29Q96ES7 293 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SCN3BQ9NY72 215 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CFAP99D6REC4 459 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SLC37A4O43826 429 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 MYL2P10916 166 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ACADSBP45954 432 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ABCG4Q9H172 646 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 AP4S1Q9Y587 144 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 XYLBO75191 536 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FMO5P49326 533 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SERPINB8P50452 374 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RCN1Q15293 331 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 ADAM2Q99965 735 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SPACA6W5XKT8 324 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 LGALS16A8MUM7 142 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 H3BRB1 525 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CXCL8P10145 99 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NCKAP1LP55160 1127 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.241e-6■■□□□ 13.7
SPTA1-201ENST00000368147 DMTNQ08495 405 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CBFBQ13951 182 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TTC39CQ8N584 583 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SKA1Q96BD8 255 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 KATNA1O75449 491 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DLGAP3O95886 979 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 AMD1P17707 334 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PSEN2P49810 448 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SSTP61278 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CCDC80Q76M96 950 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 GPC2Q8N158 579 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CYGBQ8WWM9 190 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TRIM24O15164 1050 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 CNTN2Q02246 1040 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 NCF4Q15080 339 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 B3GALT6Q96L58 329 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 PSMD3O43242 534 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTA1-201ENST00000368147 IFNA14P01570 189 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms