RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CCNG2Q16589 344 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DDR2Q16832 855 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FAM131BQ86XD5 332 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 RFX6Q8HWS3 928 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC43Q8N309 656 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 EDEM1Q92611 657 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 NPY6RQ99463 290 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 COL4A6Q14031 1691 aa16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 MAP2K7O14733 419 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA0355O15063 1070 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 RFC2P35250 354 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 MAP9Q49MG5 647 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 HDXQ7Z353 690 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 ATL2Q8NHH9 583 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 NT5C3BQ969T7 300 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.02■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 LTBP2Q14767 1821 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 M0QYT0 321 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 TNFRSF10BO14763 440 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 CAPN9O14815 690 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 LIASO43766 372 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 CAPN15O75808 1086 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 SOAT2O75908 522 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 NCAM1P13591 858 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 EPHB4P54760 987 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 NME3Q13232 169 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 KRT81Q14533 505 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 MFSD5Q6N075 450 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 NPNTQ6UXI9 565 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 GPR152Q8TDT2 470 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC114Q96M63 670 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 RAB17Q9H0T7 212 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 USP3Q9Y6I4 520 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PATJQ8NI35 1801 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D4O60343 1298 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 VNN2O95498 520 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ECEL1O95672 775 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 LTFP02788 710 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ETS1P14921 441 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 L1CAMP32004 1257 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 KRT17Q04695 432 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R7Q15435 360 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 STRADAQ7RTN6 431 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 BNIPLQ7Z465 357 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PIGVQ9NUD9 493 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.01■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PTPRSQ13332 1948 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM12O43184 909 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 AMHP03971 560 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 SLC5A3P53794 718 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 CUL1Q13616 776 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF280DQ6N043 979 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 BBS12Q6ZW61 710 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 GLIS1Q8NBF1 620 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ACTL9Q8TC94 416 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 TEKT4Q8WW24 435 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 TTPALQ9BTX7 342 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 CRISPLD1Q9H336 500 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 ANLNQ9NQW6 1124 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16■□□□□ 0.15
CASQ1-201ENST00000368078 HOMER3Q9NSC5 361 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms