RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 RGS10O43665 173 aa2.27□□□□□ -2.05
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RNU6-407P-201ENST00000365280 MACROD1Q9BQ69 325 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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