RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 SYT15Q9BQS2 421 aa21.75■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 PLIN5Q00G26 463 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 VPS28Q9UK41 221 aa21.75■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.75■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.74■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 ADCY3O60266 1144 aa21.74■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 DDHD2O94830 711 aa21.73■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 VGLL4Q14135 290 aa21.73■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 MTFR1Q15390 333 aa21.73■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.73■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 CCNG2Q16589 344 aa21.73■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.73■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.72■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 CNPY4Q8N129 248 aa21.72■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 PTPRAP18433 802 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 KCNA4P22459 653 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 RHOAP61586 193 aa21.72■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 SPASTQ9UBP0 616 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 VTA1Q9NP79 307 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 HEY2Q9UBP5 337 aa21.72■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 APOA4P06727 396 aa21.71■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 VHLP40337 213 aa21.71■■□□□ 1.07
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