RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 IL37Q9NZH6 218 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CDH23Q9H251 3354 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 FYNP06241 537 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TCF4P15884 667 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CTNNA2P26232 953 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TAF12Q16514 161 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 COMMD8Q9NX08 183 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 GMIPQ9P107 970 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PQH9 124 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PSTPIP1O43586 416 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TAF10Q12962 218 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 LILRA6Q6PI73 481 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 MON1AQ86VX9 555 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ALG3Q92685 438 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TBCBQ99426 244 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 EHD2Q9NZN4 543 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PER2O15055 1255 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF185O15231 689 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CSH1P0DML2 217 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CSH2P0DML3 217 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PRLRP16471 622 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 MIPP30301 263 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 EPHB3P54753 998 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 RAB6CQ53S08 254 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SCD5Q86SK9 330 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 COG1Q8WTW3 980 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF576Q9H609 170 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 NMUR1Q9HB89 426 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CDC23Q9UJX2 597 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PPC1 479 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 FAM92AA1XBS5 289 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PCK1P35558 622 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PGFP49763 221 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PEX5P50542 639 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CLCN4P51793 760 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 PLD1Q13393 1074 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 NPY6RQ99463 290 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ZWILCHQ9H900 591 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 COX16Q9P0S2 106 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 M0QYT0 321 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 C8AP07357 584 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 RWDD2BP57060 319 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ADAM32Q8TC27 787 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 USP18Q9UMW8 372 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA4-201ENST00000360046 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 PRPSAP2O60256 369 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 LRG1P02750 347 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 HDAC4P56524 1084 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 NME3Q13232 169 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 TUBB2AQ13885 445 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 BEND5Q7L4P6 421 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 STRADAQ7RTN6 431 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 RNF139Q8WU17 664 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 NT5C3BQ969T7 300 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 PBKQ96KB5 322 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 TLE6Q9H808 572 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA4-201ENST00000360046 RRN3Q9NYV6 651 aa22.82■■□□□ 1.24
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